Revista Cubana de Ciencias Informáticas (Mar 2013)
Granada modificado con restricción geométrica
Abstract
El desarrollo de la química computacional la ha convertido en una sólida e importante disciplina de la química moderna. Numerosos métodos han sido implementados con objetivos muy diversos. La metodología de Hipersuperficie de Múltiples Mínimos (MMH) permite el estudio de la influencia de disolventes sobre un soluto, y en general de interacciones débiles, haciendo uso de las herramientas de la química cuántica y la termodinámica estadística. Con el objetivo de explorar el espacio de configuraciones se crea un ensemble N, V, T empleando el programa GRANADA para generar celdas o supermoléculas de configuraciones diferentes del (o los) disolvente(s) que rodean al soluto. El programa GRANADA no permite restringir la generación de configuraciones del disolvente a una zona del espacio específica respecto al soluto. Esta restricción es útil para evitar la exploración innecesaria (y el consiguiente costo computacional) de las zonas del espacio que no son de interés o no representan la realidad física del problema. Por este motivo, en este trabajo se modificó el código fuente del GRANADA para implementar la restricción espacial en la generación de las celdas. Además presentamos un ejemplo de las ventajas de aplicar la restricción para la modelación de la influencia de grupos superficiales en la adsorción de Hexaclorociclohexano en Carbón Activado utilizando un modelo simple.
