Accessory Genomic Epidemiology of Cocirculating Acinetobacter baumannii Clones
Valeria Mateo-Estrada,
José Luis Fernández-Vázquez,
Julia Moreno-Manjón,
Ismael L. Hernández-González,
Eduardo Rodríguez-Noriega,
Rayo Morfín-Otero,
María Dolores Alcántar-Curiel,
Santiago Castillo-Ramírez
Affiliations
Valeria Mateo-Estrada
Programa de Genómica Evolutiva, Centro de Ciencias Genómicas, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, México
José Luis Fernández-Vázquez
Laboratorio de Infectología, Microbiología e Inmunología Clínica, Unidad de Investigación en Medicina Experimental, Facultad de Medicina, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad de México, México
Julia Moreno-Manjón
Laboratorio de Infectología, Microbiología e Inmunología Clínica, Unidad de Investigación en Medicina Experimental, Facultad de Medicina, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad de México, México
Ismael L. Hernández-González
Programa de Genómica Evolutiva, Centro de Ciencias Genómicas, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, México
Eduardo Rodríguez-Noriega
Hospital Civil de Guadalajara Fray Antonio Alcalde e Instituto de Patología Infecciosa y Experimental, Centro Universitario de Ciencias de la Salud, Universidad de Guadalajara, Guadalajara, Jalisco, México
Rayo Morfín-Otero
Hospital Civil de Guadalajara Fray Antonio Alcalde e Instituto de Patología Infecciosa y Experimental, Centro Universitario de Ciencias de la Salud, Universidad de Guadalajara, Guadalajara, Jalisco, México
María Dolores Alcántar-Curiel
Laboratorio de Infectología, Microbiología e Inmunología Clínica, Unidad de Investigación en Medicina Experimental, Facultad de Medicina, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad de México, México
Whole-genome sequencing for epidemiological investigations (genomic epidemiology) has been of paramount importance to understand the transmission dynamics of many bacterial (and nonbacterial) pathogens. Commonly, variation in the core genome, single nucleotide polymorphisms (SNPs), is employed to carry out genomic epidemiology.
