Zhejiang Daxue xuebao. Lixue ban (Nov 2019)

Assessment of genetic diversity in Amitostigma pinguiculum revealed with SRAP Markers(大花无柱兰遗传多样性的SRAP 标记分析)

  • ZHOUMengying(周梦莹),
  • TANGLujing(唐露静),
  • HUANGMengmeng(黄檬檬),
  • XUJialu(徐佳璐),
  • LUKaijie(鲁锴杰),
  • ZHUXin(朱欣),
  • JIANGMing(蒋明)

DOI
https://doi.org/10.3785/j.issn.1008-9497.2019.06.014
Journal volume & issue
Vol. 46, no. 6
pp. 724 – 730

Abstract

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大花无柱兰是一种珍稀兰科植物,具有一定的观赏和药用价值,但数量十分稀少,该物种亟待保护。本研究采用SRAP 分子标记技术,对10 个居群的115 份DNA 样品进行PCR 扩增,并开展遗传多样性分析。从81 对引物中筛选出9 个条带清晰、多态性好、重复性高的引物组合,共扩增得到305 条谱带。在物种水平上,多态性比率(PPB) 为100%,Nei’s 基因多样性指数(H) 为0.209 8,Shannon’s 指数(I) 为0.340 2;在居群水平上,PPB 为24.59%~52.13%,H 为0.079 6~0.165 5,I 为0.120 9~0.252 3。居群水平上,基因分化度(Gst)为0.520 9,基因流(Nm) 为0.459 9,遗传距离为0.091 9~0.198 4。UPGMA 聚类结果表明,10 个居群可分为3大类,地理距离相近的居群优先聚集。大花无柱兰的遗传多样性较为丰富,居群间存在一定的遗传分化和基因交流,可采用就地保护和人工栽培等方式加以保护。

Keywords