Molecular typing of HLA class II antigens in a São Paulo population

Abstract

In the present paper we show data obtained from a normal population with a racially mixed profile typical of the city of São Paulo, State of São Paulo. Data were generated with polymerase chain reaction using sequence specific primers (PCR-SSP) for HLA-DRB and polymerase chain reaction followed by hybridization with sequence specific oligonucleotide probes (PCR-SSO) for HLA-DQA1 and HLA-DQB1 loci. HLA-DRB, DQA1, DQB1 and haplotype frequencies as well as common linkage disequilibria were found. This population was also shown to be in genetic equilibrium according to the Hardy-Weinberg law. HLA-DR typing of a normal sample from the city of Porto Velho, State of Rondonia, highlighted the importance of different sets of HLA profiles found in other regions of the country. This database provides essential information for screening studies of disease associations, forensic analyses and transplants.Uma análise do perfil dos antígenos HLA de classe II numa amostra da população de São Paulo é descrita neste trabalho. Os dados foram obtidos através de técnicas de amplificação gênica utilizando-se iniciadores seqüências-específicos para HLA-DRB (PCR-SSP) ou amplificação gênica seguida de hibridação com oligonucleotídeos específicos (PCR-SSOP) para HLA-DQA e DQB. Foram calculadas as freqüências gênicas e as freqüências haplotípicas DRB-DQB e DQA-DQB e a população mostrou estar em equilíbrio genético de acordo com a lei de Hardy-Weinberg. Finalmente, comparamos também os dados obtidos com os da população de Porto Velho, Rondônia, salientando a importância da obtenção de dados regionais para os controles quando se estuda este complexo sistema genético.