普通鸬鹚基因组微卫星分布规律研究

Abstract

本研究对普通鸬鹚全基因组微卫星分布规律进行分析，结果表明：普通鸬鹚基因组中微卫星总个数为135 498个，总长度为2 304 711 bp。6种重复类型中，单碱基重复数量最多，为102 005个，占重复类型总数目的75.3%，其次是四、二、三、五、六碱基重复类型，分别占到总数的7.8%、6.9%、6.5%、3.0%、0.5% 。不同的拷贝类型在微卫星中重复拷贝类别数量有所差别，单碱基微卫星中A重复类型数量最多，所占比例为96.67%，其次是二碱基中AC最多、三碱基AAT最多、四碱基AAAC最多，所占比例分别为55.39%、30.26%、30.74%。在普通鸬鹚基因组中微卫星数量最多的前16种重复拷贝类别依次为A、AC、C、AAAC、AAT、AT、AAAT、AAC、AG、AGG、AAAG、AAGG、ACC、ACG、AACC、AGC。本研究为以后普通鸬鹚微卫星的筛选、遗传结构分析、个体识别、遗传多样性分析等方面奠定了基础。

Keywords

• 普通鸬鹚
• 微卫星
• 基因组
• 分布规律