Serie Científica de la Universidad de las Ciencias Informáticas (May 2019)
Sistema de Cómputo Distribuido, aplicado al Bioinformática
Abstract
La Bioinformática es una ciencia que acude en auxilio de la Biología cuando es necesario aplicar métodos computacionales para analizar y extraer información de un gran volumen de datos de origen biológico. Son varios los centros de investigación y universidades del país que han creado cluster de computadoras dedicadas exclusivamente para los cálculos y que pueden ser utilizados para el procesamiento de datos biológicos. Sin embargo, aun no se aprovecha toda la capacidad de cómputo en la red local de las instituciones ya que no se integran al cluster existente las máquinas que funcionan como simples estaciones de trabajo. En el presente trabajo se ofrece una alternativa de cómputo que aglutina en un solo conglomerado un conjunto de estaciones de trabajo. Para ello, se reutilizó un software existente basado en la plataforma Java al cuál se le realizaron un grupo de mejoras para adaptarlo más a la realidad de un mayor número de instituciones y lograr un mejor desempeño en los tipos de problemas a resolver. El sistema de cómputo desarrollado fue desplegado en la Facultad de Bioinformática de la Universidad de las Ciencias Informáticas y ha sido utilizado en la realización de varios cálculos distribuidos por la red.
