شناسایی چندشکلی های تک نوکلئوتیدی در جایگاه‌های ژنی IgL و IFNɣ در برخی از مرغ‌های بومی

Abstract

مقاومت ژنتیکی به بیماری‌ها در مرغ‌ها اهمیت زیادی دارد. تعیین تنوع ژنتیکی سیستم ایمنی مرغ­ها یکی از گزینه‌های اصلی جهت بررسی تفاوت‌ها در مقاومت به بیماری‌ها به شمار می‌آید. در این تحقیق، 200 نمونه­ خون از توده­های مرغ­های بومی عمومی، آذربایجان غربی، مرندی و مازندرانی اخذ و DNA­ ژنومی به روش شستشوی نمکی استخراج شد. چند­شکلی­های­ آللی در جایگاه­های ژنی IgL و IFNɣ دخیل در سیستم ایمنی با استفاده از تکنیک PCR-RFLP و ­ آنزیم­های Sau96I و Tsp509I بررسی شد. بعد از هضم آنزیمی، برای جایگاه نشانگری IgL (354 جفت بازی)، سه نوع ژنوتیپ AA، AB و BB و دو آلل A (با دو نوار 173 و 161 جفت بازی و دو نوار 10 جفت بازی) و آلل B (با سه نوار 161، 103، 70 و دو نوار 10 جفت بازی) و برای جایگاه نشانگری IFNγ (129 جفت بازی)، سه نوع ژنوتیپ CC، CG و GG و دو آلل C (با یک نوار 129 جفت بازی) و آلل G (با دو نوار 90 و 39 جفت بازی) شناسایی شد. کل توده­ها از نظر شاخص تعادل برای دو جایگاه ژنی در تعادل هاردی- واینبرگ قرار نداشتند. شاخص اطلاعات شانون در جایگاه­های نشانگری IgL و IFNɣ (به ترتیب 67/0 و 69/0)، شاخص تثبیت (به ترتیب 24/0- و 18/0-) و بیشترین مقدار شاخص هتروزیگوسیتی مشاهده ‌شده (به ترتیب 61/0 و 59/0) برآورد شد. با توجه به وجود چندشکلی در دو جایگاه ژنی مورد مطالعه، می‌توان در برنامه‌های انتخاب برای افزایش مقاومت در برابر بیماری‌ها از این ژن­های کاندیدا بهره برد.

Keywords

• چندشکلی
• ژن های igl و ifnɣ
• مرغ بومی
• pcr-rflp