eLife (Oct 2024)
Novel risk loci for COVID-19 hospitalization among admixed American populations
- Silvia Diz-de Almeida,
- Raquel Cruz,
- Andre D Luchessi,
- José M Lorenzo-Salazar,
- Miguel López de Heredia,
- Inés Quintela,
- Rafaela González-Montelongo,
- Vivian Nogueira Silbiger,
- Marta Sevilla Porras,
- Jair Antonio Tenorio Castaño,
- Julian Nevado,
- Jose María Aguado,
- Carlos Aguilar,
- Sergio Aguilera-Albesa,
- Virginia Almadana,
- Berta Almoguera,
- Nuria Alvarez,
- Álvaro Andreu-Bernabeu,
- Eunate Arana-Arri,
- Celso Arango,
- María J Arranz,
- Maria-Jesus Artiga,
- Raúl C Baptista-Rosas,
- María Barreda- Sánchez,
- Moncef Belhassen-Garcia,
- Joao F Bezerra,
- Marcos AC Bezerra,
- Lucía Boix-Palop,
- María Brion,
- Ramón Brugada,
- Matilde Bustos,
- Enrique J Calderón,
- Cristina Carbonell,
- Luis Castano,
- Jose E Castelao,
- Rosa Conde-Vicente,
- M Lourdes Cordero-Lorenzana,
- Jose L Cortes-Sanchez,
- Marta Corton,
- M Teresa Darnaude,
- Alba De Martino-Rodríguez,
- Victor del Campo-Pérez,
- Aranzazu Diaz de Bustamante,
- Elena Domínguez-Garrido,
- Rocío Eirós,
- María Carmen Fariñas,
- María J Fernandez-Nestosa,
- Uxía Fernández-Robelo,
- Amanda Fernández-Rodríguez,
- Tania Fernández-Villa,
- Manuela Gago-Dominguez,
- Belén Gil-Fournier,
- Javier Gómez-Arrue,
- Beatriz González Álvarez,
- Fernan Gonzalez Bernaldo de Quirós,
- Anna González-Neira,
- Javier González-Peñas,
- Juan F Gutiérrez-Bautista,
- María José Herrero,
- Antonio Herrero-Gonzalez,
- María A Jimenez-Sousa,
- María Claudia Lattig,
- Anabel Liger Borja,
- Rosario Lopez-Rodriguez,
- Esther Mancebo,
- Caridad Martín-López,
- Vicente Martín,
- Oscar Martinez-Nieto,
- Iciar Martinez-Lopez,
- Michel F Martinez-Resendez,
- Angel Martinez-Perez,
- Juliana F Mazzeu,
- Eleuterio Merayo Macías,
- Pablo Minguez,
- Victor Moreno Cuerda,
- Silviene F Oliveira,
- Eva Ortega-Paino,
- Mara Parellada,
- Estela Paz-Artal,
- Ney PC Santos,
- Patricia Pérez-Matute,
- Patricia Perez,
- M Elena Pérez-Tomás,
- Teresa Perucho,
- Mellina Pinsach-Abuin,
- Guillermo Pita,
- Ericka N Pompa-Mera,
- Gloria L Porras-Hurtado,
- Aurora Pujol,
- Soraya Ramiro León,
- Salvador Resino,
- Marianne R Fernandes,
- Emilio Rodríguez-Ruiz,
- Fernando Rodriguez-Artalejo,
- José A Rodriguez-Garcia,
- Francisco Ruiz-Cabello,
- Javier Ruiz-Hornillos,
- Pablo Ryan,
- José Manuel Soria,
- Juan Carlos Souto,
- Eduardo Tamayo,
- Alvaro Tamayo-Velasco,
- Juan Carlos Taracido-Fernandez,
- Alejandro Teper,
- Lilian Torres-Tobar,
- Miguel Urioste,
- Juan Valencia-Ramos,
- Zuleima Yáñez,
- Ruth Zarate,
- Itziar de Rojas,
- Agustín Ruiz,
- Pascual Sánchez,
- Luis Miguel Real,
- SCOURGE Cohort Group,
- Encarna Guillen-Navarro,
- Carmen Ayuso,
- Esteban Parra,
- José A Riancho,
- Augusto Rojas-Martinez,
- Carlos Flores,
- Pablo Lapunzina,
- Ángel Carracedo
Affiliations
- Silvia Diz-de Almeida
- ORCiD
- ERN-ITHACA-European Reference Network, Soria, Spain; Pediatric Neurology Unit, Department of Pediatrics, Navarra Health Service Hospital, Pamplona, Spain; CIBERER, ISCIII, Madrid, Spain; Centro Singular de Investigación en Medicina Molecular y Enfermedades Crónicas (CIMUS), Universidade de Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Spain
- Raquel Cruz
- ERN-ITHACA-European Reference Network, Soria, Spain; Pediatric Neurology Unit, Department of Pediatrics, Navarra Health Service Hospital, Pamplona, Spain; CIBERER, ISCIII, Madrid, Spain; Centro Singular de Investigación en Medicina Molecular y Enfermedades Crónicas (CIMUS), Universidade de Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Spain
- Andre D Luchessi
- Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Departamento de Analises Clinicas e Toxicologicas, Natal, Brazil
- José M Lorenzo-Salazar
- Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables, Santa Cruz de Tenerife, Spain
- Miguel López de Heredia
- CIBERER, ISCIII, Madrid, Spain
- Inés Quintela
- Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica, Sistema Galego de Saúde (SERGAS), Santiago de Compostela, Spain
- Rafaela González-Montelongo
- Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables, Santa Cruz de Tenerife, Spain
- Vivian Nogueira Silbiger
- ORCiD
- Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Departamento de Analises Clinicas e Toxicologicas, Natal, Brazil
- Marta Sevilla Porras
- CIBERER, ISCIII, Madrid, Spain; Instituto de Genética Médica y Molecular (INGEMM), Hospital Universitario La Paz IDIPAZ, Madrid, Spain
- Jair Antonio Tenorio Castaño
- ERN-ITHACA-European Reference Network, Soria, Spain; CIBERER, ISCIII, Madrid, Spain; Instituto de Genética Médica y Molecular (INGEMM), Hospital Universitario La Paz IDIPAZ, Madrid, Spain
- Julian Nevado
- ERN-ITHACA-European Reference Network, Soria, Spain; CIBERER, ISCIII, Madrid, Spain; Instituto de Genética Médica y Molecular (INGEMM), Hospital Universitario La Paz IDIPAZ, Madrid, Spain
- Jose María Aguado
- Unit of Infectious Diseases, Hospital Universitario 12 de Octubre, Instituto de Investigación Sanitaria Hospital 12 de Octubre (imas12), Madrid, Spain; Spanish Network for Research in Infectious Diseases (REIPI RD16/0016/0002), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain; CIBERINFEC, ISCIII, Madrid, Spain
- Carlos Aguilar
- Hospital General Santa Bárbara de Soria, Soria, Spain
- Sergio Aguilera-Albesa
- Pediatric Neurology Unit, Department of Pediatrics, Navarra Health Service Hospital, Pamplona, Spain; Navarra Health Service, NavarraBioMed Research Group, Pamplona, Spain
- Virginia Almadana
- Hospital Universitario Virgen Macarena, Neumología, Sevilla, Spain
- Berta Almoguera
- CIBERER, ISCIII, Madrid, Spain; Department of Genetics & Genomics, Instituto de Investigación Sanitaria-Fundación Jiménez Díaz University Hospital - Universidad Autónoma de Madrid (IIS-FJD, UAM), Madrid, Spain
- Nuria Alvarez
- Spanish National Cancer Research Centre, Human Genotyping-CEGEN Unit, Madrid, Spain
- Álvaro Andreu-Bernabeu
- Department of Child and Adolescent Psychiatry, Institute of Psychiatry and Mental Health, Hospital General Universitario Gregorio Marañón (IiSGM), Madrid, Spain; School of Medicine, Universidad Complutense, Madrid, Spain
- Eunate Arana-Arri
- Biocruces Bizkai HRI, Bizkaia, Spain; Cruces University Hospital, Osakidetza, Bizkaia, Spain
- Celso Arango
- Department of Child and Adolescent Psychiatry, Institute of Psychiatry and Mental Health, Hospital General Universitario Gregorio Marañón (IiSGM), Madrid, Spain; School of Medicine, Universidad Complutense, Madrid, Spain; Centre for Biomedical Network Research on Mental Health (CIBERSAM), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain
- María J Arranz
- Fundació Docència I Recerca Mutua Terrassa, Barcelona, Spain
- Maria-Jesus Artiga
- Spanish National Cancer Research Centre, CNIO Biobank, Madrid, Spain
- Raúl C Baptista-Rosas
- ORCiD
- Hospital General de Occidente, Zapopan Jalisco, Mexico; Centro Universitario de Tonalá, Universidad de Guadalajara, Tonalá Jalisco, Mexico; Centro de Investigación Multidisciplinario en Salud, Universidad de Guadalajara, Tonalá Jalisco, Mexico
- María Barreda- Sánchez
- Universidad Católica San Antonio de Murcia (UCAM), Murcia, Spain; Instituto Murciano de Investigación Biosanitaria (IMIB-Arrixaca), Murcia, Spain
- Moncef Belhassen-Garcia
- Hospital Universitario de Salamanca-IBSAL, Servicio de Medicina Interna-Unidad de Enfermedades Infecciosas, Salamanca, Spain
- Joao F Bezerra
- Escola Tecnica de Saúde, Laboratorio de Vigilancia Molecular Aplicada, Brasilia, Brazil
- Marcos AC Bezerra
- Federal University of Pernambuco, Genetics Postgraduate Program, Recife, Brazil
- Lucía Boix-Palop
- Hospital Universitario Mutua Terrassa, Barcelona, Spain
- María Brion
- Instituto de Investigación Sanitaria de Santiago (IDIS), Xenética Cardiovascular, Santiago de Compostela, Spain; CIBERCV, ISCIII, Madrid, Spain
- Ramón Brugada
- CIBERCV, ISCIII, Madrid, Spain; Cardiovascular Genetics Center, Institut d’Investigació Biomèdica Girona (IDIBGI), Girona, Spain; Medical Science Department, School of Medicine, University of Girona, Girona, Spain; Hospital Josep Trueta, Cardiology Service, Girona, Spain
- Matilde Bustos
- Institute of Biomedicine of Seville (IBiS), Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)- University of Seville- Virgen del Rocio University Hospital, Seville, Spain
- Enrique J Calderón
- Institute of Biomedicine of Seville (IBiS), Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)- University of Seville- Virgen del Rocio University Hospital, Seville, Spain; Departamento de Medicina, Hospital Universitario Virgen del Rocío, Universidad de Sevilla, Seville, Spain; CIBERESP, ISCIII, Madrid, Spain
- Cristina Carbonell
- Hospital Universitario de Salamanca-IBSAL, Servicio de Medicina Interna, Salamanca, Spain; Universidad de Salamanca, Salamanca, Spain
- Luis Castano
- CIBERER, ISCIII, Madrid, Spain; Biocruces Bizkai HRI, Bizkaia, Spain; Osakidetza, Cruces University Hospital, Bizkaia, Spain; Centre for Biomedical Network Research on Diabetes and Metabolic Associated Diseases (CIBERDEM), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain; University of Pais Vasco, UPV/EHU, Bizkaia, Spain
- Jose E Castelao
- Oncology and Genetics Unit, Instituto de Investigacion Sanitaria Galicia Sur, Xerencia de Xestion Integrada de Vigo-Servizo Galego de Saúde, Vigo, Spain
- Rosa Conde-Vicente
- Hospital Universitario Río Hortega, Valladolid, Spain
- M Lourdes Cordero-Lorenzana
- Servicio de Medicina intensiva, Complejo Hospitalario Universitario de A Coruña (CHUAC), Sistema Galego de Saúde (SERGAS), A Coruña, Spain
- Jose L Cortes-Sanchez
- Tecnológico de Monterrey, Monterrey, Mexico; Department of Microgravity and Translational Regenerative Medicine, Otto von Guericke University, Magdeburg, Germany
- Marta Corton
- CIBERER, ISCIII, Madrid, Spain; Department of Genetics & Genomics, Instituto de Investigación Sanitaria-Fundación Jiménez Díaz University Hospital - Universidad Autónoma de Madrid (IIS-FJD, UAM), Madrid, Spain
- M Teresa Darnaude
- Hospital Universitario Mostoles, Unidad de Genética, Madrid, Spain
- Alba De Martino-Rodríguez
- ORCiD
- Instituto Aragonés de Ciencias de la Salud (IACS), Zaragoza, Spain; Instituto Investigación Sanitaria Aragón (IIS-Aragon), Zaragoza, Spain
- Victor del Campo-Pérez
- Preventive Medicine Department, Instituto de Investigacion Sanitaria Galicia Sur, Xerencia de Xestion Integrada de Vigo-Servizo Galego de Saúde, Vigo, Spain
- Aranzazu Diaz de Bustamante
- Hospital Universitario Mostoles, Unidad de Genética, Madrid, Spain
- Elena Domínguez-Garrido
- Unidad Diagnóstico Molecular, Fundación Rioja Salud, La Rioja, Spain
- Rocío Eirós
- Hospital Universitario de Salamanca-IBSAL, Servicio de Cardiología, Salamanca, Spain
- María Carmen Fariñas
- IDIVAL, Cantabria, Spain; Hospital U M Valdecilla, Cantabria, Spain; Universidad de Cantabria, Cantabria, Spain
- María J Fernandez-Nestosa
- ORCiD
- Universidad Nacional de Asunción, Facultad de Politécnica, Paraguay, United States
- Uxía Fernández-Robelo
- Urgencias Hospitalarias, Complejo Hospitalario Universitario de A Coruña (CHUAC), Sistema Galego de Saúde (SERGAS), A Coruña, Spain
- Amanda Fernández-Rodríguez
- CIBERINFEC, ISCIII, Madrid, Spain; Unidad de Infección Viral e Inmunidad, Centro Nacional de Microbiología (CNM), Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), Madrid, Spain
- Tania Fernández-Villa
- CIBERESP, ISCIII, Madrid, Spain; Grupo de Investigación en Interacciones Gen-Ambiente y Salud (GIIGAS) - Instituto de Biomedicina (IBIOMED), Universidad de León, León, Spain
- Manuela Gago-Dominguez
- Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica, Sistema Galego de Saúde (SERGAS), Santiago de Compostela, Spain; IDIS, Seongnam, Republic of Korea
- Belén Gil-Fournier
- Hospital Universitario de Getafe, Servicio de Genética, Madrid, Spain
- Javier Gómez-Arrue
- Instituto Aragonés de Ciencias de la Salud (IACS), Zaragoza, Spain; Instituto Investigación Sanitaria Aragón (IIS-Aragon), Zaragoza, Spain
- Beatriz González Álvarez
- Instituto Aragonés de Ciencias de la Salud (IACS), Zaragoza, Spain; Instituto Investigación Sanitaria Aragón (IIS-Aragon), Zaragoza, Spain
- Fernan Gonzalez Bernaldo de Quirós
- Ministerio de Salud Ciudad de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina
- Anna González-Neira
- Spanish National Cancer Research Centre, Human Genotyping-CEGEN Unit, Madrid, Spain
- Javier González-Peñas
- Department of Child and Adolescent Psychiatry, Institute of Psychiatry and Mental Health, Hospital General Universitario Gregorio Marañón (IiSGM), Madrid, Spain; School of Medicine, Universidad Complutense, Madrid, Spain; Centre for Biomedical Network Research on Mental Health (CIBERSAM), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain
- Juan F Gutiérrez-Bautista
- Hospital Universitario Virgen de las Nieves, Servicio de Análisis Clínicos e Inmunología, Granada, Spain
- María José Herrero
- IIS La Fe, Plataforma de Farmacogenética, Valencia, Spain; Universidad de Valencia, Departamento de Farmacología, Valencia, Spain
- Antonio Herrero-Gonzalez
- Data Analysis Department, Instituto de Investigación Sanitaria-Fundación Jiménez Díaz University Hospital - Universidad Autónoma de Madrid (IIS-FJD, UAM), Madrid, Spain
- María A Jimenez-Sousa
- CIBERINFEC, ISCIII, Madrid, Spain; Unidad de Infección Viral e Inmunidad, Centro Nacional de Microbiología (CNM), Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), Madrid, Spain
- María Claudia Lattig
- ORCiD
- Universidad de los Andes, Facultad de Ciencias, Bogotá, Colombia; SIGEN Alianza Universidad de los Andes - Fundación Santa Fe de Bogotá, Bogotá, Colombia
- Anabel Liger Borja
- Hospital General de Segovia, Medicina Intensiva, Segovia, Spain
- Rosario Lopez-Rodriguez
- CIBERER, ISCIII, Madrid, Spain; Department of Genetics & Genomics, Instituto de Investigación Sanitaria-Fundación Jiménez Díaz University Hospital - Universidad Autónoma de Madrid (IIS-FJD, UAM), Madrid, Spain; Facultad de Farmacia, Universidad San Pablo-CEU, CEU Universities, Urbanización Montepríncipe, Boadilla del Monte, Spain
- Esther Mancebo
- Hospital Universitario 12 de Octubre, Department of Immunology, Madrid, Spain; Instituto de Investigación Sanitaria Hospital 12 de Octubre (imas12), Transplant Immunology and Immunodeficiencies Group, Madrid, Spain
- Caridad Martín-López
- Hospital General de Segovia, Medicina Intensiva, Segovia, Spain
- Vicente Martín
- CIBERESP, ISCIII, Madrid, Spain; Grupo de Investigación en Interacciones Gen-Ambiente y Salud (GIIGAS) - Instituto de Biomedicina (IBIOMED), Universidad de León, León, Spain
- Oscar Martinez-Nieto
- SIGEN Alianza Universidad de los Andes - Fundación Santa Fe de Bogotá, Bogotá, Colombia; Fundación Santa Fe de Bogota, Departamento Patologia y Laboratorios, Bogotá, Colombia
- Iciar Martinez-Lopez
- Unidad de Genética y Genómica Islas Baleares, Islas Baleares, Spain; Hospital Universitario Son Espases, Unidad de Diagnóstico Molecular y Genética Clínica, Islas Baleares, Spain
- Michel F Martinez-Resendez
- Tecnológico de Monterrey, Monterrey, Mexico
- Angel Martinez-Perez
- ORCiD
- Genomics of Complex Diseases Unit, Research Institute of Hospital de la Santa Creu i Sant Pau, IIB Sant Pau, Barcelona, Spain
- Juliana F Mazzeu
- Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Brasília, Brazil; Programa de Pós-Graduação em Ciências Médicas (UnB), Brasília, Brazil; Programa de Pós-Graduação em Ciencias da Saude (UnB), Brazila, Brazil
- Eleuterio Merayo Macías
- Hospital El Bierzo, Unidad Cuidados Intensivos, León, Spain
- Pablo Minguez
- CIBERER, ISCIII, Madrid, Spain; Department of Genetics & Genomics, Instituto de Investigación Sanitaria-Fundación Jiménez Díaz University Hospital - Universidad Autónoma de Madrid (IIS-FJD, UAM), Madrid, Spain
- Victor Moreno Cuerda
- Hospital Universitario Mostoles, Medicina Interna, Madrid, Spai, Spain; Universidad Francisco de Vitoria, Madrid, Spain
- Silviene F Oliveira
- ORCiD
- Programa de Pós-Graduação em Ciencias da Saude (UnB), Brazila, Brazil; Departamento de Genética e Morfologia, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade de Brasília, Brasília, Brazil; Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal (UnB), Brasília, Brazil; Programa de Pós-Graduação Profissional em Ensino de Biologia (UnB), Brasília, Brazil
- Eva Ortega-Paino
- Spanish National Cancer Research Centre, CNIO Biobank, Madrid, Spain
- Mara Parellada
- Department of Child and Adolescent Psychiatry, Institute of Psychiatry and Mental Health, Hospital General Universitario Gregorio Marañón (IiSGM), Madrid, Spain; School of Medicine, Universidad Complutense, Madrid, Spain; Centre for Biomedical Network Research on Mental Health (CIBERSAM), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain
- Estela Paz-Artal
- Hospital Universitario 12 de Octubre, Department of Immunology, Madrid, Spain; Instituto de Investigación Sanitaria Hospital 12 de Octubre (imas12), Transplant Immunology and Immunodeficiencies Group, Madrid, Spain; Universidad Complutense de Madrid, Department of Immunology, Ophthalmology and ENT, Madrid, Spain
- Ney PC Santos
- Universidade Federal do Pará, Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Belém, Brazil
- Patricia Pérez-Matute
- Infectious Diseases, Microbiota and Metabolism Unit, CSIC Associated Unit, Center for Biomedical Research of La Rioja (CIBIR), Logroño, Spain
- Patricia Perez
- Inditex, A Coruña, Corunna, Spain
- M Elena Pérez-Tomás
- ORCiD
- Instituto Murciano de Investigación Biosanitaria (IMIB-Arrixaca), Murcia, Spain
- Teresa Perucho
- GENYCA, Madrid, Spain
- Mellina Pinsach-Abuin
- CIBERCV, ISCIII, Madrid, Spain; Cardiovascular Genetics Center, Institut d’Investigació Biomèdica Girona (IDIBGI), Girona, Spain
- Guillermo Pita
- Spanish National Cancer Research Centre, Human Genotyping-CEGEN Unit, Madrid, Spain
- Ericka N Pompa-Mera
- Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Centro Médico Nacional Siglo XXI, Unidad de Investigación Médica en Enfermedades Infecciosas y Parasitarias, Mexico City, Mexico; Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Centro Médico Nacional La Raza, Hospital de Infectología, Mexico City, Mexico
- Gloria L Porras-Hurtado
- Clinica Comfamiliar Risaralda, Pereira, Colombia
- Aurora Pujol
- ORCiD
- CIBERER, ISCIII, Madrid, Spain; Bellvitge Biomedical Research Institute (IDIBELL), Neurometabolic Diseases Laboratory, L’Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain; Catalan Institution of Research and Advanced Studies (ICREA), Barcelona, Spain
- Soraya Ramiro León
- Hospital Universitario de Getafe, Servicio de Genética, Madrid, Spain
- Salvador Resino
- CIBERINFEC, ISCIII, Madrid, Spain; Unidad de Infección Viral e Inmunidad, Centro Nacional de Microbiología (CNM), Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), Madrid, Spain
- Marianne R Fernandes
- Universidade Federal do Pará, Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Belém, Brazil; Hospital Ophir Loyola, Departamento de Ensino e Pesquisa, Belém, Brazil
- Emilio Rodríguez-Ruiz
- IDIS, Seongnam, Republic of Korea; Unidad de Cuidados Intensivos, Hospital Clínico Universitario de Santiago (CHUS), Sistema Galego de Saúde (SERGAS), Santiago de Compostela, Spain
- Fernando Rodriguez-Artalejo
- CIBERESP, ISCIII, Madrid, Spain; Department of Preventive Medicine and Public Health, School of Medicine, Universidad Autónoma de Madrid, Madrid, Spain; IdiPaz (Instituto de Investigación Sanitaria Hospital Universitario La Paz), Madrid, Spain; IMDEA-Food Institute, CEI UAM+CSIC, Madrid, Spain
- José A Rodriguez-Garcia
- Complejo Asistencial Universitario de León, León, Spain
- Francisco Ruiz-Cabello
- IDIS, Seongnam, Republic of Korea; Instituto de Investigación Biosanitaria de Granada (ibs GRANADA), Granada, Spain; Universidad de Granada, Departamento Bioquímica, Biología Molecular e Inmunología III, Granada, Spain
- Javier Ruiz-Hornillos
- Hospital Infanta Elena, Allergy Unit, Valdemoro, Madrid, Spain; Instituto de Investigación Sanitaria-Fundación Jiménez Díaz University Hospital - Universidad Autónoma de Madrid (IIS-FJD, UAM), Madrid, Spain; Faculty of Medicine, Universidad Francisco de Vitoria, Madrid, Spain
- Pablo Ryan
- ORCiD
- CIBERINFEC, ISCIII, Madrid, Spain; Hospital Universitario Infanta Leonor, Madrid, Spain; Complutense University of Madrid, Madrid, Spain; Gregorio Marañón Health Research Institute (IiSGM), Madrid, Spain
- José Manuel Soria
- Genomics of Complex Diseases Unit, Research Institute of Hospital de la Santa Creu i Sant Pau, IIB Sant Pau, Barcelona, Spain
- Juan Carlos Souto
- Haemostasis and Thrombosis Unit, Hospital de la Santa Creu i Sant Pau, IIB Sant Pau, Barcelona, Spain
- Eduardo Tamayo
- Hospital Clinico Universitario de Valladolid, Servicio de Anestesiologia y Reanimación, Valladolid, Spain; Universidad de Valladolid, Departamento de Cirugía, Valladolid, Spain
- Alvaro Tamayo-Velasco
- Hospital Clinico Universitario de Valladolid, Servicio de Hematologia y Hemoterapia, Valladolid, Spain
- Juan Carlos Taracido-Fernandez
- Data Analysis Department, Instituto de Investigación Sanitaria-Fundación Jiménez Díaz University Hospital - Universidad Autónoma de Madrid (IIS-FJD, UAM), Madrid, Spain
- Alejandro Teper
- Hospital de Niños Ricardo Gutierrez, Buenos Aires, Argentina
- Lilian Torres-Tobar
- Fundación Universitaria de Ciencias de la Salud, Bogotá, Colombia
- Miguel Urioste
- Spanish National Cancer Research Centre, Familial Cancer Clinical Unit, Madrid, Spain
- Juan Valencia-Ramos
- University Hospital of Burgos, Burgos, Spain
- Zuleima Yáñez
- Universidad Simón Bolívar, Facultad de Ciencias de la Salud, Barranquilla, Colombia
- Ruth Zarate
- Centro para el Desarrollo de la Investigación Científica, Asunción, Paraguay
- Itziar de Rojas
- Centre for Biomedical Network Research on Neurodegenerative Diseases (CIBERNED), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain; Research Center and Memory clinic, ACE Alzheimer Center Barcelona, Universitat Internacional de Catalunya, Barcelona, Spain
- Agustín Ruiz
- Centre for Biomedical Network Research on Neurodegenerative Diseases (CIBERNED), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain; Research Center and Memory clinic, ACE Alzheimer Center Barcelona, Universitat Internacional de Catalunya, Barcelona, Spain
- Pascual Sánchez
- CIEN Foundation/Queen Sofia Foundation Alzheimer Center, Madrid, Spain
- Luis Miguel Real
- ORCiD
- Hospital Universitario de Valme, Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Sevilla, Spain
- SCOURGE Cohort Group
- Encarna Guillen-Navarro
- Instituto Murciano de Investigación Biosanitaria (IMIB-Arrixaca), Murcia, Spain; Sección Genética Médica - Servicio de Pediatría, Hospital Clínico Universitario Virgen de la Arrixaca, Servicio Murciano de Salud, Murcia, Spain; Departamento Cirugía, Pediatría, Obstetricia y Ginecología, Facultad de Medicina, Universidad de Murcia (UMU), Murcia, Spain; Grupo Clínico Vinculado, Centre for Biomedical Network Research on Rare Diseases (CIBERER), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain
- Carmen Ayuso
- CIBERER, ISCIII, Madrid, Spain; Department of Genetics & Genomics, Instituto de Investigación Sanitaria-Fundación Jiménez Díaz University Hospital - Universidad Autónoma de Madrid (IIS-FJD, UAM), Madrid, Spain
- Esteban Parra
- ORCiD
- Department of Anthropology, University of Toronto at Mississauga, Mississauga, Canada
- José A Riancho
- ORCiD
- CIBERER, ISCIII, Madrid, Spain; IDIVAL, Cantabria, Spain; Hospital U M Valdecilla, Cantabria, Spain; Universidad de Cantabria, Cantabria, Spain
- Augusto Rojas-Martinez
- ORCiD
- Tecnologico de Monterrey, Escuela de Medicina y Ciencias de la Salud, Monterrey, Mexico
- Carlos Flores
- ORCiD
- Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables, Santa Cruz de Tenerife, Spain; Research Unit, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria, Instituto de Investigación Sanitaria de Canarias, Santa Cruz de Tenerife, Spain; Department of Clinical Sciences, University Fernando Pessoa Canarias, Las Palmas de Gran Canaria, Spain; Centre for Biomedical Network Research on Respiratory Diseases (CIBERES), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain
- Pablo Lapunzina
- ERN-ITHACA-European Reference Network, Soria, Spain; CIBERER, ISCIII, Madrid, Spain; Instituto de Genética Médica y Molecular (INGEMM), Hospital Universitario La Paz IDIPAZ, Madrid, Spain
- Ángel Carracedo
- ORCiD
- CIBERER, ISCIII, Madrid, Spain; Centro Singular de Investigación en Medicina Molecular y Enfermedades Crónicas (CIMUS), Universidade de Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Spain; Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica, Sistema Galego de Saúde (SERGAS), Santiago de Compostela, Spain; IDIS, Seongnam, Republic of Korea
- DOI
- https://doi.org/10.7554/eLife.93666
- Journal volume & issue
-
Vol. 13
Abstract
The genetic basis of severe COVID-19 has been thoroughly studied, and many genetic risk factors shared between populations have been identified. However, reduced sample sizes from non-European groups have limited the discovery of population-specific common risk loci. In this second study nested in the SCOURGE consortium, we conducted a genome-wide association study (GWAS) for COVID-19 hospitalization in admixed Americans, comprising a total of 4702 hospitalized cases recruited by SCOURGE and seven other participating studies in the COVID-19 Host Genetic Initiative. We identified four genome-wide significant associations, two of which constitute novel loci and were first discovered in Latin American populations (BAZ2B and DDIAS). A trans-ethnic meta-analysis revealed another novel cross-population risk locus in CREBBP. Finally, we assessed the performance of a cross-ancestry polygenic risk score in the SCOURGE admixed American cohort. This study constitutes the largest GWAS for COVID-19 hospitalization in admixed Latin Americans conducted to date. This allowed to reveal novel risk loci and emphasize the need of considering the diversity of populations in genomic research.
Keywords