بهینه کردن کیفی و کمی محصول واکنش زنجیره ای پلیمراز ژن FOXE1 به عنوان ژنی غنی از GC

Abstract

مقاله پژوهشیمقدمه: تقریباً 3 درصد از ژنوم انسان غنی از GC است. این نواحی اغلب در پروموتر ژن‌ها، به ویژه ژن‌های خانه‌دار و ژن‌های سرکوب‌گر تومور یافت می‌شوند. تکثیر این مناطق غنی از GC می‌تواند چالش برانگیز باشد. زیرا پایداری توالی DNA غنی از GC بیشتر بوده، همچنین ساختارهای ثانویه به آسانی در این مناطق تشکیل می‌شوند. ژن FOXE1 به خانواده بزرگی از فاکتورهای رونویسی تعلق دارد که برای مورفوژنز غده‌ی تیروئید ضروری می‌باشد و به‌عنوان فاکتور مستعد‌کننده در سرطان تیروئید غیر مدولاری نوع 4 معرفی شده است.روش‌ها: مطالعه‌ی حاضر از نوع تجربی است که به نحوه‌ی تکثیر قسمتی از توالی ژن FOXE1 با درصد بالای GC که با واکنش زنجیره‌ای پلیمراز معمولی قابل انجام نمی‌باشد پرداخته است.یافته‌ها: نتایج این مطالعه نشان داد، استفاده از مواد تقویت‌کننده‌ی تکثیر مناطق غنی از GC، نظیر بتائین ودی متیل سولفوکسید (DMSO) به همراه واکنش زنجیره‌ای پلیمراز از نوع Touchdown در تکثیر توالی این ناحیه از ژن FOXE1 با تخریب ساختارهای ثانویه تشکیل شده در توالی و افزایش محصول واکنش مؤثر می‌باشد.نتیجه‌گیری: این روش می‌تواند برای تکثیر نواحی غنی از GC در ژن‌های دیگر، که درصد مشابهی از GC با ژن FOXE1 دارند به‌کار گرفته شود.

Keywords

• توالی غنی از gc
• foxe1
• بتائین
• dmso
• touchdown pcr