Выявление и идентификация возбудителей бактериальных болезней пшеницы и ячменя в России

Abstract

Экспорт зерна представляет собой важную статью продовольственного бизнеса в России. Импортерами российского зерна являются страны Европы, Азии, Африки и Южной Америки. Каждая страна-импортер предъявляет свои требования к фитосанитарному состоянию ввозимой продукции. Важным требованием импортеров является отсутствие в партиях зерна таких возбудителей бактериальных болезней зерновых культур, как Pectobacterium rhapontici , Rathayibacter tritici , Pseudomonas fuscovaginae , Pseudomonas syringae pvs., Acidovorax avenae subsp. avenae , Xanthomonas translucens pvs., Rathayibacter rathayi и Pseudomonas cichorii . Достоверная информация о распространении данных видов бактерий на территории Российской Федерации ограничена. Методы выявления и идентификации возбудителей бактериозов на сегодняшний день не разработаны, что повышает риск распространения фитопатогенов, способных нанести существенный экономический вред сельскому хозяйству. Цель данного исследования состояла в выявлении и идентификации возбудителей бактериальных болезней пшеницы и ячменя. Для этого нами был проведен сбор образцов растительного материала пшеницы и ячменя в Родионово-Несветайском, Мясниковском, Зерноградском, Азовском и Мартыновском районах Ростовской области. Представители различных штаммов бактерий были выделены из полученных образцов с использованием соответствующих питательных сред. Тестирование штаммов было проведено методом полимеразно-цепной реакции (ПЦР) с использованием праймеров, разработанных для участка 16S рибосомальной РНК (PSF/PSR и 8UA/519B), и праймеров SyD1/SyD2, подобранных для участка генома Pseudomonas syringae (GenBank CP047267.1), с последующим секвенированием по Сэнгеру. В результате из проб пшеницы и ячменя были выделены и идентифицированы штаммы следующих бактерий: Curtobacterium sp., Paenibacillus sp., Enterobacteriaceae , Pseudomonas azotoformans , P. poae , P. azotoformans , P. hibiscicola , P. fluorescens , Stenotrophomonas sp., P. syringae pv. syringae , P. syringae pv. atrofaciens , Bacillus sp., Erwinia sp., Pantoea sp. и Pantoea agglomerans .