Nature Communications (Sep 2018)
Combining discovery and targeted proteomics reveals a prognostic signature in oral cancer
- Carolina Moretto Carnielli,
- Carolina Carneiro Soares Macedo,
- Tatiane De Rossi,
- Daniela Campos Granato,
- César Rivera,
- Romênia Ramos Domingues,
- Bianca Alves Pauletti,
- Sami Yokoo,
- Henry Heberle,
- Ariane Fidelis Busso-Lopes,
- Nilva Karla Cervigne,
- Iris Sawazaki-Calone,
- Gabriela Vaz Meirelles,
- Fábio Albuquerque Marchi,
- Guilherme Pimentel Telles,
- Rosane Minghim,
- Ana Carolina Prado Ribeiro,
- Thaís Bianca Brandão,
- Gilberto de Castro,
- Wilfredo Alejandro González-Arriagada,
- Alexandre Gomes,
- Fabio Penteado,
- Alan Roger Santos-Silva,
- Márcio Ajudarte Lopes,
- Priscila Campioni Rodrigues,
- Elias Sundquist,
- Tuula Salo,
- Sabrina Daniela da Silva,
- Moulay A. Alaoui-Jamali,
- Edgard Graner,
- Jay W. Fox,
- Ricardo Della Coletta,
- Adriana Franco Paes Leme
Affiliations
- Carolina Moretto Carnielli
- Laboratório de Espectrometria de Massas, Laboratório Nacional de Biociências (LNBio), Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM)
- Carolina Carneiro Soares Macedo
- Laboratório de Espectrometria de Massas, Laboratório Nacional de Biociências (LNBio), Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM)
- Tatiane De Rossi
- Laboratório de Espectrometria de Massas, Laboratório Nacional de Biociências (LNBio), Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM)
- Daniela Campos Granato
- Laboratório de Espectrometria de Massas, Laboratório Nacional de Biociências (LNBio), Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM)
- César Rivera
- Laboratório de Espectrometria de Massas, Laboratório Nacional de Biociências (LNBio), Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM)
- Romênia Ramos Domingues
- Laboratório de Espectrometria de Massas, Laboratório Nacional de Biociências (LNBio), Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM)
- Bianca Alves Pauletti
- Laboratório de Espectrometria de Massas, Laboratório Nacional de Biociências (LNBio), Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM)
- Sami Yokoo
- Laboratório de Espectrometria de Massas, Laboratório Nacional de Biociências (LNBio), Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM)
- Henry Heberle
- Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação, Universidade de São Paulo (USP)
- Ariane Fidelis Busso-Lopes
- Laboratório de Espectrometria de Massas, Laboratório Nacional de Biociências (LNBio), Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM)
- Nilva Karla Cervigne
- Departamento de Diagnóstico Oral, Faculdade de Odontologia de Piracicaba Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
- Iris Sawazaki-Calone
- Centro de Ciências Biológicas e da Saúde, Faculdade de Odontologia, Universidade Estadual do Oeste do Paraná
- Gabriela Vaz Meirelles
- Laboratório de Espectrometria de Massas, Laboratório Nacional de Biociências (LNBio), Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM)
- Fábio Albuquerque Marchi
- Centro Internacional de Pesquisa-CIPE - A.C.Camargo Cancer Center and Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Oncogenômica (INCiTO)
- Guilherme Pimentel Telles
- Instituto de Computação, Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
- Rosane Minghim
- Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação, Universidade de São Paulo (USP)
- Ana Carolina Prado Ribeiro
- Serviço de Odontologia Oncológica, Instituto do Câncer do Estado de São Paulo, ICESP-FMUSP
- Thaís Bianca Brandão
- Serviço de Odontologia Oncológica, Instituto do Câncer do Estado de São Paulo, ICESP-FMUSP
- Gilberto de Castro
- Serviço de Oncologia Clínica, Instituto do Câncer do Estado de São Paulo, Octavio Frias de Oliveira, ICESP
- Wilfredo Alejandro González-Arriagada
- Facultad de Odontología, Universidad de Valparaíso
- Alexandre Gomes
- Waters Corporation
- Fabio Penteado
- Waters Corporation
- Alan Roger Santos-Silva
- Departamento de Diagnóstico Oral, Faculdade de Odontologia de Piracicaba Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
- Márcio Ajudarte Lopes
- Departamento de Diagnóstico Oral, Faculdade de Odontologia de Piracicaba Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
- Priscila Campioni Rodrigues
- Cancer and Translational Medicine Research Unit, University of Oulu
- Elias Sundquist
- Cancer and Translational Medicine Research Unit, University of Oulu
- Tuula Salo
- Cancer and Translational Medicine Research Unit, University of Oulu
- Sabrina Daniela da Silva
- Department of Otolaryngology-Head and Neck Surgery, Jewish General Hospital, McGill University
- Moulay A. Alaoui-Jamali
- Lady Davis Institute for Medical Research and Segal Cancer Center, SMBD Jewish General Hospital, Departments of Medicine and Oncology, Faculty of Medicine, McGill University
- Edgard Graner
- Departamento de Diagnóstico Oral, Faculdade de Odontologia de Piracicaba Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
- Jay W. Fox
- Department of Microbiology, Immunology and Cancer Biology, University of Virginia
- Ricardo Della Coletta
- Departamento de Diagnóstico Oral, Faculdade de Odontologia de Piracicaba Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
- Adriana Franco Paes Leme
- Laboratório de Espectrometria de Massas, Laboratório Nacional de Biociências (LNBio), Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM)
- DOI
- https://doi.org/10.1038/s41467-018-05696-2
- Journal volume & issue
-
Vol. 9,
no. 1
pp. 1 – 17
Abstract
Oral cancer has region-specific histopathological and molecular characteristics, complicating its classification by the standard tumor-node-metastasis system. Here, the authors combine discovery and targeted proteomics with IHC to identify region-specific and saliva biomarkers for oral cancer prognosis.