Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban (Jan 2018)
Maroteaux-Lamy综合征的ARSB基因分析及新突变的致病性鉴定
Abstract
【目的】对7家拟诊为Maroteaux_Lamy综合征(MPSⅥ)的患儿及其父母进行ARSB基因的突变检测 和新突变的致病性鉴定,以揭示其分子发病机制,为将来的产前/植入前基因诊断等创造前提条件。【方法】在 临床初诊及GAG尿检和MPS酶检的基础上,抽取患儿及其父母EDTA抗凝血,进行ARSB基因的PCR扩增和 Sanger测序。对所发现的新突变,在经HGMD、1000G和ExAC等数据库核实排查后,首先用SWISS-MODEL软件 分析、比对突变蛋白和正常蛋白的空间构象,然后用ClustalX软件分析跨物种氨基酸的保守性,用PROVEAN、 SIFT、PolyPhen-2软件预测新突变的致病性,最后用ACMG标准对新突变的致病性进行综合分析鉴定。【结果】 1) 7个家系先证者的基因检测结果分别为:No1: c.574T>C,p.C192R纯合错义突变;No2: c.160G>A/p.D54N(来 自其母)和c.1197C>G/p.F399L(来自其父)的复合杂合子;No3:仅检出c.1072G>A/p.V358M和IVS5as(-27)A> C变异,但酶检和临床表型符合VI型;No4:为c.281C>T,p.S94L(新突变,来自其母)和IVS5as(-27)A>C(来自 其父)的复合杂合子;No5:为c.1197C>G,p.F399L纯合错义突变;No6:为c.1197C>G,p.F399L(来自其母)和 c.1379C>T,p.S460F(新突变,来自其父)的复合杂合子;No7:为c.499G>A,p.G167R(来自其父)和c.1325C> T,p.T442M(来自其母)的复合杂合子。2)新突变鉴定结果:对正常ARSB酶蛋白和p.S94L突变酶蛋白的空间构 象的预测比对结果显示,两者有明显区别;跨物种保守性分析结果显示, p.94突变点所在氨基酸(S)在物种进化 过程中具有高度保守性;PROVEAN、SIFT和PolyPhen-2软件对p.S94L预测结果分别为:Deleterious、Damaging和 Probablydamaging。用上述方法对p.S460F的预测结果及ACMG的综合分析结果也显示该突变可能是致病性 的。【结论】1)家系4的p.S94L和家系6的p.S460F新突变可能都是新的致病性突变,有可能都是引起患儿发病 的内在原因之一。2)家系1, 2, 5, 6, 7可以确诊为MPSVI型,其基因型和表现型具有显著的相关性,家系3虽经 酶检确诊,临床症状和尿检结果也都与MPSVI型符合,但却未能在DNA水平查到明确的突变类型,其表现型与 基因型的相关性还有待进一步证实。