پژوهشهای علوم دامی ایران (May 2012)
بررسی چند شکلی نشانگرهای ریزماهواره ایBM6444، INRA135 و oarhh35 مرتبط با ژن اینهیبین در گوسفند سنجابی
Abstract
هدف از تحقیق حاضر شناسایی میزان پلیمورفیسم در نشانگرهای ریزماهوارهای BM6444، INRA135 و oarhh35 مرتبط با ژن اینهیبین در گوسفند سنجابی بود. برای این منظور به طور تصادفی از 100 راس (78 میش و 22 قوچ) ایستگاه تحقیقات دامپروری مهرگان کرمانشاه خونگیری به عمل آمد. با استفاده از روش نمکی بهینه یافته نمونه های DNA استخراج شدند. از واکنش زنجیرهای پلیمراز و جفت آغازگرهای اختصاصی جایگاه های ریز ماهوارهای برای تکثیر قطعه های مورد آزمایش استفاده گردید. در این آزمایش برای شناسایی ژنوتیپهای حاصل از روش رنگ آمیزی نیترات نقره و ژل پلی اکریلآمید با درصدهای مختلف برای هر نشانگر استفاده گردید. ژنوتیپهای مشاهده شده به کمک نرم افزارهای Popgene نسخه 32/1 و Cervus نسخه 2 آنالیز گردیدند. نتایج نشان دادند که نشانگر BM6444چند شکل بوده و 4 آلل و 4 ژنوتیپ به ترتیب با فراوانیهای (12/0D:، 31/0C:، 38/0B:، 18/0A:) و (38/0BC: ، 12/0AB:، 18/0CD:، 32/0AD:) را در بر میگیرد. شاخص چندشکلی (PIC) و تعداد آللهای موثر در این جایگاه به ترتیب 62/0 و 42/3 بودند. برای نشانگر ریز ماهوارهای INRA135، 6 آلل با فراوانیهای (19/0F:، 11/0E:، 09/0D:، 21/:0C، 25/0B:، 21/:0A) و سه ژنوتیپ با فراوانیهای (42/0AB:، 27/0CD:، 29/0 BD:) مشاهده گردید. شاخص چندشکلی (PIC) و تعداد آللهای موثر در این جایگاه به ترتیب 72/0 و 21/5 بودند. در ریزماهواره oarhh35 نتایج نشان دادند که این نشانگر نیز چند شکل بوده و 3 آلل با فراوانیهای (42/0C:، 28/0B:، 29/0A:) و دو ژنوتیپ با فراوانیهای (68/0BC:، 32/0AB:) را در بر میگیرد. شاخص چندشکلی (PIC) و تعداد آللهای موثر برای oarhh35 نیز به ترتیب 71/0 و 48/2 بودند.
Keywords