Nature Communications (Nov 2022)
Connecting multiple microenvironment proteomes uncovers the biology in head and neck cancer
- Ariane F. Busso-Lopes,
- Leandro X. Neves,
- Guilherme A. Câmara,
- Daniela C. Granato,
- Marco Antônio M. Pretti,
- Henry Heberle,
- Fábio M. S. Patroni,
- Jamile Sá,
- Sami Yokoo,
- César Rivera,
- Romênia R. Domingues,
- Ana Gabriela C. Normando,
- Tatiane De Rossi,
- Barbara P. Mello,
- Nayane A. L. Galdino,
- Bianca A. Pauletti,
- Pammela A. Lacerda,
- André Afonso N. Rodrigues,
- André Luis M. Casarim,
- Reydson A. de Lima-Souza,
- Ingrid I. Damas,
- Fernanda V. Mariano,
- Kenneth J. Gollob,
- Tiago S. Medina,
- Nilva K. Cervigne,
- Ana Carolina Prado-Ribeiro,
- Thaís Bianca Brandão,
- Luisa L. Villa,
- Miyuki Uno,
- Mariana Boroni,
- Luiz Paulo Kowalski,
- Wilfredo Alejandro González-Arriagada,
- Adriana F. Paes Leme
Affiliations
- Ariane F. Busso-Lopes
- Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM
- Leandro X. Neves
- Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM
- Guilherme A. Câmara
- Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM
- Daniela C. Granato
- Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM
- Marco Antônio M. Pretti
- Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional, Divisão de Pesquisa Experimental e Translacional, Instituto Nacional do Câncer - INCA
- Henry Heberle
- Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação, Universidade de São Paulo - USP
- Fábio M. S. Patroni
- Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética – CBMEG, Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP
- Jamile Sá
- Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM
- Sami Yokoo
- Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM
- César Rivera
- Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM
- Romênia R. Domingues
- Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM
- Ana Gabriela C. Normando
- Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM
- Tatiane De Rossi
- Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM
- Barbara P. Mello
- Departamento de Radiologia e Oncologia, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo – USP
- Nayane A. L. Galdino
- Centro Internacional de Pesquisa - CIPE, A.C. Camargo Cancer Center
- Bianca A. Pauletti
- Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM
- Pammela A. Lacerda
- Departamento de Clínica Médica, Faculdade de Medicina de Jundiaí - FMJ
- André Afonso N. Rodrigues
- Departamento de Cirurgia de Cabeça e Pescoço, Faculdade de Medicina de Jundiaí - FMJ
- André Luis M. Casarim
- Departamento de Cirurgia de Cabeça e Pescoço, Faculdade de Medicina de Jundiaí - FMJ
- Reydson A. de Lima-Souza
- Departamento de Diagnóstico Oral, Faculdade de Odontologia de Piracicaba, Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP
- Ingrid I. Damas
- Departamento de Patologia, Faculdade de Ciências Médicas, Universidade Estadual de Campinas – UNICAMP
- Fernanda V. Mariano
- Departamento de Patologia, Faculdade de Ciências Médicas, Universidade Estadual de Campinas – UNICAMP
- Kenneth J. Gollob
- Centro Internacional de Pesquisa - CIPE, A.C. Camargo Cancer Center
- Tiago S. Medina
- Centro Internacional de Pesquisa - CIPE, A.C. Camargo Cancer Center
- Nilva K. Cervigne
- Departamento de Clínica Médica, Faculdade de Medicina de Jundiaí - FMJ
- Ana Carolina Prado-Ribeiro
- Departamento de Diagnóstico Oral, Faculdade de Odontologia de Piracicaba, Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP
- Thaís Bianca Brandão
- Instituto do Câncer do Estado de São Paulo - ICESP, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo - USP
- Luisa L. Villa
- Departamento de Radiologia e Oncologia, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo – USP
- Miyuki Uno
- Instituto do Câncer do Estado de São Paulo - ICESP, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo - USP
- Mariana Boroni
- Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional, Divisão de Pesquisa Experimental e Translacional, Instituto Nacional do Câncer - INCA
- Luiz Paulo Kowalski
- Departamento de Cirurgia de Cabeça e Pescoço e Otorrinolaringologia, A.C. Camargo Cancer Center
- Wilfredo Alejandro González-Arriagada
- Facultad de Odontología, Patología Oral y Maxilofacial, Universidad de Los Andes
- Adriana F. Paes Leme
- Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM
- DOI
- https://doi.org/10.1038/s41467-022-34407-1
- Journal volume & issue
-
Vol. 13,
no. 1
pp. 1 – 24
Abstract
The biological understanding of poor prognosis associated with lymph node metastasis in head and neck cancer (HNC) remains crucial. Here, a proteomic characterisation of 140 multisite samples from a 59-HNC patient cohort and machine learning reveals potential biomarkers and metastasis related signatures.
