Zhejiang Daxue xuebao. Lixue ban (Sep 2009)

Analysis of bacterial diversity in deep-sea sediments from Pacific polymetallic nodule province(太平洋多金属结核区深海沉积物细菌多样性分析)

  • ZHANGWen-jie(张文杰),
  • ZHANGXin-qi(张心齐),
  • YINGYi(应意),
  • XUXue-wei(许学伟),
  • WUMin(吴敏)

DOI
https://doi.org/10.3785/j.issn.1008-9497.2009.05.022
Journal volume & issue
Vol. 36, no. 5
pp. 578 – 585

Abstract

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从太平洋多金属结核区东区两个站点沉积物中直接提取环境总基因组,通过PCR及TA克隆分别构建了16S rRNA基因文库.经序列分析结果表明,2个文库共93个克隆分属13个类群,包括α变形菌纲、β变形菌纲、γ变形菌纲、δ变形菌纲、浮霉菌门、酸杆菌门、噬纤维菌-黄杆菌-拟杆菌群、硝化螺旋菌门、放线菌门、绿弯菌门、厚壁菌门、异常球菌-栖热菌门和OP11类群.其中,γ变形菌纲的细菌在2个站点沉积物中都是优势种群,变形菌纲、浮霉菌门、放线菌门、噬纤维菌-黄杆菌-拟杆菌群、硝化螺旋菌门是2个站点共有的细菌类群.DOTUR和LIBSHUFF数据分析结果表明,两个站点的沉积物均具有丰富的细菌多样性,并且物种组成具有显著性差异.

Keywords