Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban (Jul 2023)

基于全外显子组测序对头皮皮脂腺癌的基因分析

  • 郑奔容,
  • 王一娜,
  • 江博雄,
  • 梁亚乐,
  • 蔡胜军,
  • 张娜娜

Journal volume & issue
Vol. 44
pp. 712 – 717

Abstract

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目的在全外显子组水平对比头皮皮脂腺癌(SC)和头皮皮脂腺瘤(SA)的相关致病性基因突变的差异。方法对经过病理诊断的头皮SC和SA样本各1例,利用 Illumina HiSeq 2500平台进行全外显子组测序(WES)。筛选可疑的单核苷酸变异位点,进行突变的保守性和功能分析。利用SciClone软件来追踪亚克隆进化可以得到每例肿瘤样本的克隆性图谱信息。通过MutSigCV软件筛选得到高频显著基因,将体细胞变异与已知驱动基因进行比较,筛选出该肿瘤样本中的已知驱动基因。结果经过对比发现,与头皮SA相比,SC存在两个驱动基因ACVR1B和TFDP1的基因突变。结论头皮SC 驱动基因ACVR1B和TFDP1的基因突变如果能在更大的病例队列中得到证实,对其发生的可能机制以及治疗靶点有重要的意义。

Keywords