The impact of transposable elements on tomato diversity

Marisol Domínguez; Elise Dugas; Médine Benchouaia; Basile Leduque; José M Jiménez-Gómez; Vincent Colot; Leandro Quadrana

doi:10.1038/s41467-020-17874-2

Nature Communications (Aug 2020)

The impact of transposable elements on tomato diversity

Marisol Domínguez,
Elise Dugas,
Médine Benchouaia,
Basile Leduque,
José M Jiménez-Gómez,
Vincent Colot,
Leandro Quadrana

Affiliations

Marisol Domínguez: Institut de Biologie de l’Ecole Normale Supérieure (IBENS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Ecole Normale Supérieure, PSL Research University
Elise Dugas: Institut de Biologie de l’Ecole Normale Supérieure (IBENS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Ecole Normale Supérieure, PSL Research University
Médine Benchouaia: Genomic facility, Institut de Biologie de l’Ecole Normale Supérieure (IBENS), Département de biologie, École normale supérieure, CNRS, INSERM, Université PSL
Basile Leduque: Institut de Biologie de l’Ecole Normale Supérieure (IBENS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Ecole Normale Supérieure, PSL Research University
José M Jiménez-Gómez: Institut Jean-Pierre Bourgin, INRAE, AgroParisTech, Université Paris-Saclay
Vincent Colot: Institut de Biologie de l’Ecole Normale Supérieure (IBENS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Ecole Normale Supérieure, PSL Research University
Leandro Quadrana: Institut de Biologie de l’Ecole Normale Supérieure (IBENS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Ecole Normale Supérieure, PSL Research University

DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-020-17874-2
Journal volume & issue: Vol. 11, no. 1
pp. 1 – 11

Abstract

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Transposable element insertion polymorphisms (TIPs) are a potential source of large effect alleles. Here, the authors use genome resequencing data for 602 tomato accessions together with transcriptomic and extensive phenotypic information to investigate the contribution of TIPs to tomato diversity.

Published in Nature Communications

ISSN: 2041-1723 (Online)
Publisher: Nature Portfolio
Country of publisher: United Kingdom
LCC subjects: Science
Website: https://www.nature.com/ncomms/

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