Etat actuel du séquençage et de la connaissance du génome des espèces animales

Abstract

Depuis la première publication du génome humain en 2001, les génomes de nombreuses espèces animales d’intérêt agronomique ontété séquencés ou sont en cours de séquençage. Après la réalisation de l’assemblage des génomes pour les espèces majeures par laméthode de Sanger* et des séquenceurs capillaires, la nouvelle génération de séquenceurs parallèles (NGS : Next GenerationSequencing) permet maintenant le séquençage rapide et à bas coût d’un nombre bien plus grand d’espèces. Un rappel sur les diversprincipes du séquençage et de l’assemblage des génomes, permettant de mieux comprendre leurs avantages et leurs limites, est suivid’une description de l’état d’avancement de la connaissance des génomes des animaux d’intérêt agronomique. Finalement, quelquesexemples de domaines d’utilisation des génomes assemblés sont rapidement décrits.