Revista Brasileira de Ciência do Solo (Jun 2008)
Avaliação da biodiversidade de rizóbios simbiontes do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.) em Santa Catarina Assessment of biodiversity in rhizobia symbionts of common bean (Phaseolus vulgaris L.) in Santa Catarina, Brazil
Abstract
Os solos brasileiros, em geral, apresentam uma população abundante de rizóbios capazes de nodular e fixar N2 em simbiose com o feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.); contudo, a diversidade dessas bactérias ainda é pouco conhecida. Este estudo teve por objetivo conhecer a biodiversidade de microssimbiontes do feijoeiro em Santa Catarina e, para isso, foram obtidos 117 isolados de nódulos de plantas coletadas em campo, em 23 áreas do extremo oeste, do meio oeste e do planalto sul catarinense. Com base nos atributos morfofisiológicos, os isolados foram classificados em nove grupos. Pela análise dos perfis de DNA após a amplificação (PCR) com o "primer" BOX, que codifica regiões conservadas e repetidas do genoma, 107 perfis distintos foram agrupados em um nível final de similaridade de apenas 26,9 %. Os perfis obtidos pela amplificação do gene 16S ribossômico - referência na taxonomia atual de procariotos - seguida pela digestão com três enzimas de restrição (técnica de RFLP-PCR), resultaram em seis agrupamentos principais e cinco bactérias isoladas. As populações consistiram de 17,1 % de Rhizobium tropici, 35,9 % de R. etli, 32,5 % de R. leguminosarum, 1,7 % de R. giardinii e 12,8 % com perfis distintos das espécies descritas de rizóbios de feijoeiro. R. tropici predominou em solos ácidos do meio oeste e do planalto sul, R. leguminosarum não foi detectado no extremo oeste e R. etli ocorreu nas três regiões, essas duas últimas espécies em solos menos ácidos. Os resultados enfatizam a diversidade genética elevada de rizóbios, inter e intra-específica, nos solos catarinenses, inclusive com a indicação de novas espécies.Brazilian soils usually present a great number of populations of rhizobial bacteria capable of nodulating and fixing N2 in symbiosis with common bean (Phaseolus vulgaris L.), but the diversity of these bacteria is still poorly known. This study aimed to assess the biodiversity of micro-symbionts of common bean in the state of Santa Catarina in southern Brazil. One-hundred and seventeen isolates were obtained from field-grown plants in 23 areas of the far west, midwest and southern plateau of Santa Catarina. Based on morpho-physiological properties, the isolates were classified in nine groups. The DNA analysis by BOX-PCR, with the amplification of conserved and repetitive genome regions, detected 107 different profiles joined at a final similarity level of only 26.9 %, i.e., a high level of genetic diversity. The profiles obtained by the amplification of the 16S rRNA gene, followed by the digestion with three restriction enzymes (RFLP-PCR technique) defined six main groups and five isolated bacteria. The population consisted of 17.1 % Rhizobium tropici, 35.9 % R. etli, 32.5 % R. leguminosarum, 1.7 % R. giardinii and 12.8 % yet undocumented profiles of the common bean rhizobial species. R. tropici predominated in the acid soils of the midwest and southern plateau, R. leguminosarum was not detected in the far west and R. etli occurred in all three regions, while the last two species predominated in less acid soils. The results demonstrate the high inter- and intra-specific rhizobial diversity in the soils of Santa Catarina, besides indicating new species.
Keywords
