شناسایی مناطق ژنومی تحت انتخاب مثبت کنترل کننده صفات ساختاری بدن در نژادهای مختلف بز

Abstract

هدف از این پژوهش، شناسایی مناطق ژنومی تحت انتخاب مرتبط با صفات ساختاری بدن در نژادهای مختلف بز بود. بدین ­منظور، از اطلاعات ژنوتیپی 728 رأس بزهای غیرخویشاوند متعلق به چهار نژاد مختلف تعیین ژنوتیپ شده با آرایه­های­50K ­ استفاده شد. جهت شناسایی نواحی ژنومی تحت انتخاب از دو آزمون آماری برآوردگر نااریب FST (تتا) و hapFLK استفاده شد. نتایج حاصل از آماره تتا منجر به شناسایی هشت ناحیه ژنومی روی کروموزوم­های شماره­ 3، 4، 7، 13، 15، 18، 20 و 29 شد. ژن­های کاندیدای شناسایی شده مرتبط با صفات ساختاری شامل ژن­های TGFBR3، CALCR، ACAD8، BCAR1 و ADAMTS6 بودند و عملکردهای متفاوتی شامل رشد و توسعه عضلات اسکلتی، طول بدن، تنظیم کانال کلسیمی، هموستازی الیاف ماهیچه­ای، میزان خوراک مصرفی، ساخت پروتئین و اندازه سلول ماهیچه­ای داشتند. به­علاوه، بررسی QTLهای گزارش شده در مناطق انتخابی و اورتولوگوس گاوی، قرار داشتن QTLهای مرتبط با افزایش وزن بدن، عرض کپل و وزن متابولیکی بدن را نشان داد. همچنین، نتایج حاصل از آماره hapFLK در این پژوهش، منجر به شناسایی پنج ناحیه ژنومی روی کروموزوم­های شماره 1، 5، 6، 13 و 30 شد. ژن­های کاندیدای شناسایی شده در این مناطق ژنومی شامل FNDC3B، STAB2 و CCNY بودند و عملکردهای متفاوتی در تکثیر فیبروبلاست­ها و تمایز سلول­های استخوانی داشتند. ژن­هایی که در نواحی ژنومی شناسایی شدند، می­توانند بر اساس عملکرد به­عنوان کاندیداهای تحت انتخاب مثبت مطرح باشند. در هر حال، نیاز به بررسی­های پیوستگی و عملکردی بیشتری جهت شناسایی عملکرد ژن­ها وجود دارد. استفاده از یافته­های این تحقیق می­تواند باعث تسریع در پیشرفت ژنتیکی برنامه­های اصلاح نژادی بز شود.

Keywords

• انتخاب
• بز
• ژن کاندیدا
• صفات ساختاری
• مناطق ژنومی