Ciência e Agrotecnologia (Jun 2005)
Molecular characterization of elephantgrass accessions through RAPD markers Caracterização molecular de acessos de capim-elefante utilizando marcadores RAPD
Abstract
Elephantgrass pastures are limited by yield variations and reductions in forage quality and availability, thus making the search for genotypes with reduced seasonality a major concern. In order to verify the extent of genetic variability among contrasting cultivars, ten elephantgrass accessions were analyzed through DNA amplification by RAPD technique. A total of 160 DNA bands were generated with the use of 44 random primers and 23% of these bands were monomorphic for all accessions. Gel-obtained binary data (1 for presence and 0 for absence) were used for generating a genetic distance matrix, which was utilized in a UPGMA grouping analysis. Elephantgrass cultivars Cameroon and Vruckwona were the accessions mostly divergent from the others, with an average genetic distance of 0.34. The accessions with the lowest average genetic distances from the others were Pioneiro and CNPGL 27-5, both with a distance of 0.25. Overall, genetic distances ranged from 0.06 to 0.43, indicating little genetic variability for the set of accessions, despite the contrasting morphology of the studied genotypes.O cultivo do capim-elefante é limitado por variações na produção de biomassa e por reduções na qualidade e disponibilidade de forragem, tornando prioritária a busca de genótipos com menor sazonalidade de produção. Para verificar a extensão da variabilidade genética entre cultivares contrastantes, 10 acessos foram analisados via amplificação do DNA pela técnica RAPD. Foram utilizados 44 primers aleatórios, que produziram um total de 160 bandas de DNA, sendo que 23% das bandas analisadas foram monomórficas para todos os acessos. Os dados binários, originados dos géis (1-presença, 0-ausência), foram utilizados para gerar uma matriz de distâncias genéticas, que foi utilizada para uma análise de agrupamento segundo o método da média das distâncias (UPGMA). Os acessos mais divergentes dos demais foram Cameroon e Vruckwona, com distâncias genéticas médias de 0,34. Os acessos com menores distâncias genéticas médias dos demais foram Pioneiro e CNPGL 27-5, ambos com uma distância genética média de 0,25. As distâncias genéticas, considerando todas as análises, variaram de 0,06 a 0,43, indicando uma variabilidade genética pouco acentuada, embora os acessos estudados sejam bastante contrastantes em relação à morfologia e fisiologia.
Keywords
