Tecnociencia Chihuahua (Oct 2020)
Técnicas serológicas y moleculares utilizadas para la identificación y caracterización de Beet curly top virus
Abstract
El Beet curly top virus pertenece al género curtovirus, dentro de la familia Geminiviridae; su genoma está constituido por una cadena sencilla de ADN cubierto por una cápside icosaédrica geminada. La organización de su genoma revela que el ADN de los curtovirus produce seis o siete proteínas. El producto del ORF V1 es la proteína de la cápside del virión, el del ORF V2 está involucrado en la regulación de los niveles de ADN genómico y el del ORF V3 facilita el movimiento de célula a célula. Las cuatro proteínas codificadas por los ORFs de sentido complementario están involucradas en la replicación del virus. ORF C1 codifica la proteína Rep, C3 una proteína análoga para la replicación de la proteína de los begomovirus, y la C4 es una proteína que puede iniciar la división celular; la función de la C2 es desconocida. Las especies de BCTV causan enfermedades en cultivos hortícolas como chile, frijol y tomate, los cuales son económica y socialmente importantes en el estado de Chihuahua; sin embargo, hay muy poca información de este virus en el estado, es por eso que en esta revisión enfatizamos en las técnicas serológicas y moleculares para la identificación del virus, así como en los métodos de clonación, secuenciación y análisis filogenético para su caracterización, con el fin de poner a disposición esta información para técnicos e investigadores interesados en estudios específicos del BCTV, así como en el manejo de las enfermedades causadas por las cepas de este virus. Abstract Beet curly top virus belongs to the genus Curtovirus, within the family Geminiviridae; its genome is composed of a single stranded DNA covered with an icosahedral geminate capsid. The organization of its genome reveals that Curtovirus DNA produces six or seven proteins. The product of ORF V1 is the virion coat protein, that of ORF V2 is involved in regulation of the genomic DNA levels, and that of ORF V3 facilitates the cell- to-cell movement of the virus. The four proteins encoded by the complementary-sense ORFs are involved in virus replication. ORF C1 encodes the Rep protein, C3 a protein analogous to the replication enhancer protein of begomoviruses, and C4 a protein that can initiate cell division; the function of C2 is unknown. The species of BCTV cause diseases in horticultural crops such as beans, pepper, and tomato that are economically and socially important in Chihuahua State. However, there is limited information about this virus in the State. Thus, in this review, we emphasize the serological and molecular methods for identification of this virus, as well as the clonation, sequencing, and phylogenetic analysis for its characterization with the objective of providing this information to technicians and researchers interested in specific studies of BCTV, as well as in the management of the diseases caused by strains of this virus. Keywords: Curtovirus, Geminivirus, typing of BCTV, sequencing methods, clonation, phylogenetic analysis.
