AGGREGATIBACTER SPP.: ANÁLISES PANGÊNOMICAS IN SILICO

Abstract

Objetivos: Realização de análises pangenômicas nas espécies do gênero Aggregatibacter, utilizando ferramentas de Bioinformática. Materiais e métodos: Os genomas foram baixados no banco de dados RefSeq depositados no NCBI (National Center for Biotechnology Information) totalizando 34 linhagens, incluindo 33 do gênero Aggregatibacter e uma do outgroup Haemophilus somnus. Para essas análise, foram utilizados os softwares Gegenees e SplitsTree, para análise filogenômica e filogenética, respectivamente. Já para análises de sintenia gênica, foi utilizado o software Mauve. Resultados: Os resultados do Gegenees revelaram consistentes similaridades intragrupais, variando de 75% a 100%, enquanto as intergrupais demonstraram taxas reduzidas, entre 16% e 35%. O SplitsTree corroborou essas descobertas, evidenciando clados e uma notável afinidade genética entre A. aphophilus e A. segnis em comparação com A. actinomycetecomitans. A análise do Mauve identificou mudanças estruturais, como inversões e translocações, indicando dinâmica evolutiva. Discussão: As avaliações do Gegenees e SplitsTree demonstraram heterogeneidade gênica, porém com níveis consideráveis de similaridade interespécies. A notável proximidade entre A. aphophilus e A. segnis, em contraste com A. actinomycetecomitans, sugere uma afinidade genética mais estreita. As análises do Mauve reforçam essa dinâmica, destacando semelhanças evolutivas entre clados e sublinhagens. A presença de mutações estruturais, como inversões e translocações, reforça a dinâmica evolutiva e a baixa sintenia gênica. Conclusão: A aplicação de ferramentas bioinformáticas permitiu uma análise pangenômica das espécies de Aggregatibacter, evidenciando semelhanças intra e interespécies. Essas descobertas oferecem perspectivas valiosas para compreender as relações entre essas bactérias e os genes compartilhados. Ademais, esse estudo possui implicações relevantes na área da saúde, considerando que as Aggregatibacter spp. são patógenos humanos. A proximidade genética identificada sugere a possibilidade de investigações futuras para alvos terapêuticos e vacinais abrangentes para todo o gênero.