Scientific Data (Sep 2022)
A georeferenced rRNA amplicon database of aquatic microbiomes from South America
- Sebastian Metz,
- Paula Huber,
- Erick Mateus-Barros,
- Pedro C. Junger,
- Michaela de Melo,
- Inessa Lacativa Bagatini,
- Irina Izaguirre,
- Mariana Câmara dos Reis,
- Maria E. Llames,
- Victoria Accattatis,
- María Victoria Quiroga,
- Melina Devercelli,
- María Romina Schiaffino,
- Juan Pablo Niño-García,
- Marcela Bastidas Navarro,
- Beatriz Modenutti,
- Helena Vieira,
- Martin Saraceno,
- Carmen Alejandra Sabio y García,
- Emiliano Pereira,
- Alvaro González-Revello,
- Claudia Piccini,
- Fernando Unrein,
- Cecilia Alonso,
- Hugo Sarmento
Affiliations
- Sebastian Metz
- Laboratorio de Ecología Acuática, Instituto Tecnológico de Chascomús (INTECH), UNSAM-CONICET
- Paula Huber
- Laboratorio de Plancton Instituto Nacional de Limnología (INALI), CONICET-UNL, Ciudad Universitaria, Paraje El Pozo, C. P
- Erick Mateus-Barros
- Laboratory of Microbial Processes & Biodiversity, Departamento de Hydrobiologia, Universidade Federal de São Carlos (UFSCar). Rodovia Washington Luiz
- Pedro C. Junger
- Laboratory of Microbial Processes & Biodiversity, Departamento de Hydrobiologia, Universidade Federal de São Carlos (UFSCar). Rodovia Washington Luiz
- Michaela de Melo
- Laboratory of Microbial Processes & Biodiversity, Departamento de Hydrobiologia, Universidade Federal de São Carlos (UFSCar). Rodovia Washington Luiz
- Inessa Lacativa Bagatini
- Laboratório de Ficologia, Departamento de Botânica, Universidade Federal de São Carlos (UFSCar). Rodovia Washington Luiz
- Irina Izaguirre
- Depto. de Ecología, Genética y Evolución, IEGEBA (UBA-CONICET), Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires (UBA). Intendente Güiraldes 2160
- Mariana Câmara dos Reis
- Laboratory of Microbial Processes & Biodiversity, Departamento de Hydrobiologia, Universidade Federal de São Carlos (UFSCar). Rodovia Washington Luiz
- Maria E. Llames
- Laboratorio de Ecología Acuática, Instituto Tecnológico de Chascomús (INTECH), UNSAM-CONICET
- Victoria Accattatis
- Laboratorio de Plancton Instituto Nacional de Limnología (INALI), CONICET-UNL, Ciudad Universitaria, Paraje El Pozo, C. P
- María Victoria Quiroga
- Laboratorio de Ecología Acuática, Instituto Tecnológico de Chascomús (INTECH), UNSAM-CONICET
- Melina Devercelli
- Laboratorio de Plancton Instituto Nacional de Limnología (INALI), CONICET-UNL, Ciudad Universitaria, Paraje El Pozo, C. P
- María Romina Schiaffino
- Departamento de Ciencias Básicas y Experimentales, Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires (UNNOBA)
- Juan Pablo Niño-García
- Escuela de Microbiología, Universidad de Antioquia
- Marcela Bastidas Navarro
- Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Medio Ambiente (INIBIOMA), CONICET-Universidad Nacional del Comahue
- Beatriz Modenutti
- Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Medio Ambiente (INIBIOMA), CONICET-Universidad Nacional del Comahue
- Helena Vieira
- Laboratório de Ficologia, Departamento de Botânica, Universidade Federal de São Carlos (UFSCar). Rodovia Washington Luiz
- Martin Saraceno
- Depto. de Ecología, Genética y Evolución, IEGEBA (UBA-CONICET), Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires (UBA). Intendente Güiraldes 2160
- Carmen Alejandra Sabio y García
- Depto. de Ecología, Genética y Evolución, IEGEBA (UBA-CONICET), Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires (UBA). Intendente Güiraldes 2160
- Emiliano Pereira
- Centro Universitario Regional del Este. Universidad de la República
- Alvaro González-Revello
- Departamento de Ciencia y Tecnología de los Alimentos, Facultad de Veterinaria
- Claudia Piccini
- Laboratorio de Ecología Microbiana Acuática, Departamento de Microbiología, Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable
- Fernando Unrein
- Laboratorio de Ecología Acuática, Instituto Tecnológico de Chascomús (INTECH), UNSAM-CONICET
- Cecilia Alonso
- Centro Universitario Regional del Este. Universidad de la República
- Hugo Sarmento
- Laboratory of Microbial Processes & Biodiversity, Departamento de Hydrobiologia, Universidade Federal de São Carlos (UFSCar). Rodovia Washington Luiz
- DOI
- https://doi.org/10.1038/s41597-022-01665-z
- Journal volume & issue
-
Vol. 9,
no. 1
pp. 1 – 12
Abstract
Measurement(s) taxonomic diversity assessment by targeted gene survey Technology Type(s) next generation DNA sequencing Sample Characteristic - Organism Bacteria • Archaea Sample Characteristic - Environment aquatic environment Sample Characteristic - Location South America