Nature Communications (Jul 2018)
A mosaic monoploid reference sequence for the highly complex genome of sugarcane
- Olivier Garsmeur,
- Gaetan Droc,
- Rudie Antonise,
- Jane Grimwood,
- Bernard Potier,
- Karen Aitken,
- Jerry Jenkins,
- Guillaume Martin,
- Carine Charron,
- Catherine Hervouet,
- Laurent Costet,
- Nabila Yahiaoui,
- Adam Healey,
- David Sims,
- Yesesri Cherukuri,
- Avinash Sreedasyam,
- Andrzej Kilian,
- Agnes Chan,
- Marie-Anne Van Sluys,
- Kankshita Swaminathan,
- Christopher Town,
- Hélène Bergès,
- Blake Simmons,
- Jean Christophe Glaszmann,
- Edwin van der Vossen,
- Robert Henry,
- Jeremy Schmutz,
- Angélique D’Hont
Affiliations
- Olivier Garsmeur
- CIRAD (Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement), UMR AGAP
- Gaetan Droc
- CIRAD (Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement), UMR AGAP
- Rudie Antonise
- KEYGENE N.V.
- Jane Grimwood
- HudsonAlpha Institute for Biotechnology
- Bernard Potier
- SASRI (South African Sugarcane Research Institute)
- Karen Aitken
- CSIRO (Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation)
- Jerry Jenkins
- HudsonAlpha Institute for Biotechnology
- Guillaume Martin
- CIRAD (Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement), UMR AGAP
- Carine Charron
- CIRAD (Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement), UMR AGAP
- Catherine Hervouet
- CIRAD (Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement), UMR AGAP
- Laurent Costet
- CIRAD, UMR PVBMT
- Nabila Yahiaoui
- CIRAD (Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement), UMR AGAP
- Adam Healey
- HudsonAlpha Institute for Biotechnology
- David Sims
- HudsonAlpha Institute for Biotechnology
- Yesesri Cherukuri
- HudsonAlpha Institute for Biotechnology
- Avinash Sreedasyam
- HudsonAlpha Institute for Biotechnology
- Andrzej Kilian
- Diversity Arrays Technology
- Agnes Chan
- J. Craig Venter Institute
- Marie-Anne Van Sluys
- Universidade de Sao Paulo
- Kankshita Swaminathan
- HudsonAlpha Institute for Biotechnology
- Christopher Town
- J. Craig Venter Institute
- Hélène Bergès
- INRA-CNRGV
- Blake Simmons
- JBEI Joint BioEnergy Institute
- Jean Christophe Glaszmann
- CIRAD (Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement), UMR AGAP
- Edwin van der Vossen
- KEYGENE N.V.
- Robert Henry
- QAAFI (Queensland Alliance for Agriculture and Food Innovation), University of Queensland
- Jeremy Schmutz
- HudsonAlpha Institute for Biotechnology
- Angélique D’Hont
- CIRAD (Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement), UMR AGAP
- DOI
- https://doi.org/10.1038/s41467-018-05051-5
- Journal volume & issue
-
Vol. 9,
no. 1
pp. 1 – 10
Abstract
Sugarcane (Saccharum spp.) is a crop of major economic significance but has complex genome structure. Here, the authors generate a BAC-based monoploid sugarcane reference sequence.