Zhejiang Daxue xuebao. Lixue ban (Sep 2007)

Partial sequence of bop gene for Haloterrigena thermotolerans JCM 1I050T(嗜盐古菌Haloterrigena thermotolerans JCM 11050Tbop基因序列研究)

  • LIYong-hua(李永华),
  • JINWen-tao(金文涛),
  • HUOYing-yi(霍颖异),
  • WUMin(吴敏)

DOI
Journal volume & issue
Vol. 34, no. 5
pp. 576 – 579

Abstract

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对标准菌株Haloterrigena ihermotolerans JCM 11050T,其编码螺旋C至螺旋G的细菌视紫红质(bacteriorhodopsin, BR)蛋白基因(bop基因)片断采用PCR方法进行了扩增,TA克隆并测定了其核苷酸序列.对翻译出的氨基酸序列进行亲水性分析,表明该菌株的BR蛋白与已报道相应序列具有类似的二级结构.蛋白序列聚合比对结果表明,该菌株BR蛋白与Natrinema属的BR蛋白具有一定相似性.在这一Haloterrigena属的标准菌株中证实bop基因,进一步丰富了bop基因资源.

Keywords