Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban (Jan 2023)
DNA损伤修复基因<italic>FANCI</italic>与肝癌预后和免疫浸润相关性
Abstract
目的探究DNA损伤修复基因FANCI在肝癌中的表达水平,及其与预后、临床分期、免疫浸润的关系。方法在本研究中,使用TCGA、GTEx、TIMER2.0及qRT-PCR法、蛋白质印迹法和免疫组织化学法研究FANCI在肝癌中的表达及其与不同临床分期之间的相关性;使用Kaplan-Meier Plotter数据库分析FANCI与肝癌预后的关系;使用TISIDB数据库探索FANCI与肝癌免疫细胞浸润及免疫检查点的关系;使用STRING数据库探索FANCI相结合的蛋白;使用TCGA及GTEx数据库进行GO及KEGG富集分析;通过细胞实验探索了FANCI在肝癌中的作用。结果与正常组织相比,肝癌组织FANCI的mRNA和蛋白表达水平上调(P<0.001);高表达FANCI的肝癌患者预后较差(P<0.001);肝癌组织中FANCI的表达与组织活化的CD4+T细胞数目、Th2细胞数目及免疫检查点基因的表达呈正相关,且FANCI高表达组的B细胞及巨噬细胞浸润水平明显较低(P<0.01);GO及KEGG富集分析显示FANCI相关基因富集在氨基酸跨膜转运体活性等多种生物过程中;细胞实验发现敲低FANCI后,肝癌的增殖、侵袭及迁移能力下降(P<0.05)。结论FANCI在肝癌组织中高表达,可能起抑制抗肿瘤免疫的作用,并作用于氨基酸跨膜转运等通路,与不良预后相关,敲低FANCI后,肝癌的增殖、侵袭及迁移能力得到抑制。