Actualidades Biológicas (Dec 2012)

MODESTR: UNA HERRAMIENTA INFORMÁTICA PARA EL ESTUDIO DE LOS ECOSISTEMAS ACUÁTICOS DE COLOMBIA MODESTR: A SOFTWARE TOOL FOR STUDYING OF COLOMBIAN AQUATIC ECOSYSTEMS

  • Patricia Pelayo-Villamil,
  • Cástor Guisande,
  • Luis González-Vilas,
  • Juan D. Carvajal-Quintero,
  • Luz F. Jiménez-Segura,
  • Emilio García-Roselló,
  • Juergen Heine,
  • Jacinto González-Dacosta,
  • Ana Manjarrés-Hernández,
  • Antonio Vaamonde,
  • Carlos Granado-Lorencio

Journal volume & issue
Vol. 34, no. 97
pp. 225 – 239

Abstract

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El objetivo de este trabajo es mostrar las utilidades del programa informático ModestR, en estudios sobre distribución de especies en ecosistemas marinos y de agua dulce de Colombia. Este programa se encuentra disponible en la Web de manera gratuita: ModestR" target="_blank"http://www.ipez.es/ModestR. Para enseñar y probar el funcionamiento de ModestR se trabajó con los datos disponibles en el Global Biodiversity Information Facility (GBIF, 2012) de los órdenes Characiformes y Siluriformes, como ejemplo de especies de peces dulciacuícolas, y del orden Carcharhiniformes de especies marinas. ModestR incluye en su fase inicial, dos aplicaciones: DataManager y MapMaker. La aplicación DataManager está diseñada para realizar manejo integrado de información taxonómica y mapas de distribución de cualquier grupo de especies. La aplicación MapMaker permite generar mapas de distribución de especies de cuatro formas diferentes: 1) importando un archivo CSV con el nombre de las especies y las coordenadas geográficas, 2) importando los datos automáticamente del GBIF, 3) importando las coordenadas geográficas generadas de modelos de distribución y 4) realizando mapas expertos, lo cual consiste en seleccionar las áreas de distribución, de acuerdo a los tipos de hábitats en que ocurre la o las especies en estudio. La posibilidad de trabajar con hábitats es una de las contribuciones más importantes de ModestR y, en particular, la de que los hábitats lóticos pequeños (quebradas, arroyos, etc.), los lóticos grandes (ríos) y los lenticos (lagunas, lagos, embalses, ciénagas, etc.) están cartografiados con muy alta resolución. Además, también se diferencian los ecosistemas marino y terrestre. A pesar de que este estudio se enfocó en especies de ecosistemas acuáticos, ModestR permite también realizar el mismo tipo de ejercicios con especies terrestres.The aim of this manuscript is to show the usefulness of the software package ModestR in studies of distribution of Colombian marine and freshwater species. This software is free available at the Website: ModestR" target="_blank"http://www.ipez.es/ModestR. To show and test the potential of ModestR, here an exemplar assessment is presented of a database using all valid species of freshwater fishes of the orders Characiformes and Siluriformes, and their geographical records available in the Global Biodiversity Information Facility (GBIF, 2012), and of the order Carcharhiniformes as representatives of marine species. ModestR includes, in its initial phase, two applications: DataManager and distribution of any species group. The application MapMaker has been designed to generate species distribution maps in four different ways: 1) by importing a CSV file with the name of the species and their geographical coordinates, 2) importing the geographical records automatically from GBIF, 3) importing geographical coordinates generated by distribution models, and 4) making expert maps by selecting distribution areas, according to the types of habitats occupied by the species. The possibility of working with habitats is one of the most important contributions of ModestR and, in particular, that are mapped small lotic ecosystems (creeks, streams, etc.), large lotic ecosystems (rivers) and lentic ecosystems (ponds, lakes, reservoirs, swamps, etc.). Moreover, it is also possible to select marine and terrestrial ecosystems. Therefore, although the manuscript has been focused on species of aquatic ecosystems, ModestR also allows the same type of studies with terrestrial species.

Keywords