空肠弯曲杆菌诱导的结直肠癌的转录组学分析

Abstract

目的探究空肠弯曲杆菌（C. jejuni）的致癌机制。方法将18只雌性的C57BL/6 ApcMin/+小鼠随机分为C. jejuni感染组9只和空白对照组9只。采用灌胃C. jejuni和葡聚糖硫酸盐共同诱导ApcMin/+小鼠产生结直肠癌。实验终点时，取各组小鼠结直肠组织解剖计数肿瘤个数，分别提取C. jejuni组4只小鼠和空白对照组3只小鼠的结直肠肿瘤和癌旁组织RNA，采用RNA-seq技术进行转录组学测序，筛选出差异表达基因后进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果与对照组相比，C. jejuni感染组肿瘤发生率显著增高（P < 0.01），显示造模成功。RNA-seq测序结果显示，C. jejuni感染组的肿瘤组织跟两个对照组相比，分别有394个和501个差异表达基因（变化>4倍；P < 0.05）。GO富集分析差异基因主要富集在多种免疫反应的调控和激活途径、多种蛋白质转运和受体结合途径。KEGG通路富集分析癌症相关通路和代谢途径较显著。上述差异表达基因中，有17个基因在两次对照中均有出现，经过筛选，得到14个“核心”差异表达基因。在进一步的qRT-PCR验证中，有9个基因表达差异显著，其中有3个基因（Gm1987、Saxo1和Plekhs1）表达上调，6个基因（Lrp2、Serpina3c、Fabp4、Tmem52、Lrrn4和Upk3b）表达下调。结论本研究指出了9个可能在C. jejuni诱导的结直肠癌的发生发展中起到了重要且独特作用的宿主基因，为后续研究C. jejuni导致结直肠癌的机制提供了新的方向和思路。

Keywords

• 空肠弯曲杆菌;结直肠癌;转录组