LPS- PCR تاپینگ ایزوله‌های ایرانی پاستورلامولتوسیدای گوسفندی، براساس ژن‌های بیوسنتزکننده هسته خارجی (1L تا 8LPS (L

Abstract

پاستورلا مولتوسیدا یک باکتری گرم منفی است که عامل ایجاد بیماری­های مختلفی در بسیاری از گونه های حیوانی و انسانی می­باشد. آنچه که آشکار است LPS یک فاکتور بیماری­زای مهم می باشد که هر تغییر کوچکی در ساختار LPS باعث اثرات اساسی در توانایی ایجاد بیماری توسط پاستورلا مولتوسیدا در میزبانش می­شود و نیزLPS می­تواند به عنوان یک فاکتور مهم در سیستم تایپینگ سوماتیک، برای شناسایی و طبقه بندی باکتری مورد استفاده قرار گیرد. ژنوتیپLPS جدایه های گوسفندی، با استفاده از 8 جفت پرایمر اختصاصی ژن های بیوسنتزهسته خارجی LPS تعیین شدند. سپس ژن­های LPS تکثیر یافته به وسیله واکنش زنجیره­ای پلیمراز، تعیین توالی شده و با توالی­های موجود در بانک ژن مورد مقایسه قرار گرفتند. از 32 جدایه پاستورلا مولتوسیدای گوسفندی مورد آزمایش، 21 جدایه با فراوانی (62/65%) دارای ژنوتیپ 6L، 9 جدایه با فراوانی( 12/28%) دارای ژنوتیپ 3L، 1 جدایه با فراوانی( 12/3%) شامل هر دو ژنوتیپ 3L و 6L بودند. 1 جدایه با فراوانی (12/3%) غیر قابل تیپ بندی بود. روش LPS-PCR توانست ژنوتیپ 31 مورد از 32 جدایه فیلدی مورد مطالعه را تعیین نماید. بر اساس آنالیز فیلوژنتیکی، جدایه­های ژنوتیپ L3 در دو زیر شاخه مجزا قرار گرفتند. درصد تشابه توالی ژن های LPS در بین جدایه­های گوسفندی ژنوتیپ با توالی­های موجود در بانک ژن بطور قابل توجهی بالا (5/99%>) بود. LPS-PCR یک روش ژنوتایپینگ دقیق است که می­تواند سویه های پاستورلا مولتوسیدا را در یکی از هشت ژنوتیپ LPS طبقه بندی نماید.

Keywords

• پاستورلا مولتوسیدا
• گوسفند
• هسته خارجی LPS
• تعیین تیپ با روش واکنش زنجیره‌ای پلیمراز